Realizó sus estudios de composición en el CIEM en la Ciudad de México, en el Conservatorio de Rotterdam, y en el IRCAM en París. Las dotaciones de sus obras varían entre orquesta sinfónica, música de cámara con electrónica, y con frecuencia en conjunto con multimedia. Su trabajo investiga materiales no convencionales, al tiempo que se adentra en territorios microtonales y experimenta con combinaciones tímbricas inusuales. Waller ha desarrollado y construido sus propios instrumentos, diseñados para ser interpretados por músicos en vivo. Ha sido acreedor a varios premios y becas, incluyendo premio NOG para orquesta (1999), Fundación Camargo (2006) y Sistema Nacional de Creadores de Arte (2008, 2011, 2016). Entre sus obras se encuentran Teguala, cuarteto de percusión para 120 azulejos y electrónica; Calumnia para gran orquesta; y Eye Masking para soprano y ensemble.